絶滅生物の痕跡は現生生物のどんなゲノム領域に残りやすい?

~ アゴハゼのゲノム解析が暴く「ゲノムの中の幽霊」 ~

ポイント

・アゴハゼの種内系統の1つが、絶滅した“ゴースト系統”との古代の交雑により誕生したことを示しました。
・絶滅したゴースト系統由来のゲノムが受け継がれたゲノム領域や、逆にゴースト系統由来のゲノムが失われてしまったゲノム領域の特徴を初めて解明しました。
・本研究の成果は、絶滅系統が現在の生物多様性に果たす役割や、生物の交雑ゲノム構成を決める普遍的なルールの解明に繋がると期待されます。

概要

 東京大学大学院農学生命科学研究科附属水産実験所の加藤柊也大学院生、平瀬祥太朗助教、菊池潔教授らの研究グループは、アゴハゼというハゼ科魚類の種内系統の1つが絶滅した“ゴースト系統(注1)”との交雑により誕生した系統であることを示しました。さらに、この種内系統について詳細な集団ゲノミクス解析(注2)を行うことで、絶滅系統のゲノムが生き残ったゲノム領域や、逆に絶滅系統由来のゲノムが失われてしまったゲノム領域の特徴を解明しました。

用語解説

(注1)ゴースト系統(ghost lineage)
現時点でサンプリングできておらず、DNAのような遺伝情報に基づく証拠が存在しない系統のこと。手でつかむことができない正体不明な存在であることを「幽霊」に例えた呼称である。絶滅系統のうちDNAが取得できるのはごく一部であるため、ほとんどの絶滅系統はゴースト系統であるといえる。
(注2)集団ゲノミクス(population genomics)
生物の複数個体のゲノムを分析することで、集団の進化の歴史やメカニズムを解明しようとする学問のこと。

詳細

詳細はプレスリリースをご参照ください。

【12/8開催】Science Cafe : シリコンバレーや世界の有力スタートアップエコシステムから学ぶアジアの未来

【12/11開催】第26回生きものサロン「3分で家が完成?!オタマボヤのハウス建築」

関連記事

  1. 木のナノファイバーの構造制御により、ヒト歯髄幹細…

    〜樹木由来のセルロースナノファイバーで目指す歯の再生医療〜農学研究院…

  2. [1/21開催]第219回アジア・オセアニア研究…

    佐伯 雄一 教授(宮崎大学 農学部 農学部門動植物資源生命科学領域)…

  3. 令和4年度農学部附属演習林北海道演習林 公開講座…

    「野外セミナー・十勝の森と樹木」令和4年度農学部附属演習林北海道演習…

  4. 【11/22開催】九州大学筑紫地区地域連携推進チ…

    ~「黄砂〜春の厄介な風物詩〜」~九州大学筑紫キャンパス・筑紫地区…

  5. 植物の季節応答を担う遺伝子の種を超えた共通性と多…

    ~冬に共通する遺伝子の働きを発見、植物の季節応答を制御する仕組みの進化の理解…

  6. 国内絶滅と思われていた水生昆虫、56年ぶりに再発…

    〜 標本の3Dモデルをオンライン公開 〜 日本を含めモンスーンアジア…

  7. 流域システム工学研究室が「第13回グッドライフア…

    工学研究院 流域システム工学研究室林 博徳 准教授、鹿野 雄一特任准教授…

  8. 鳴き声の順序に応じた行動変化:昆虫で初実証

    ツクツクボウシの「オーシンツクツク」と「ツクリヨーシ」の発音順序に対するオス…